System został stworzony głównie z myślą o serwisach informacyjnych, portalach tematycznych, gazetach i archiwach internetowych. Może być także wykorzystywany przez wszystkie sklepy internetowe oferujące produkty i usługi elektroniczne – np. pliki muzyczne.
Do założenia konta w systemie MikroPłatności nie są wymagane żadne dokumenty potwierdzające, czy też pisemna umowa z użytkownikiem. Użytkownik nie musi posiadać ani karty płatniczej ani rachunku bankowego. Wystarczy jednynie wypełnić formularz znajdujący się na stronach www.mikroplatnosci.pl. Konto może być zasilane zarówno przekazami pocztowymi jak i kartą płatniczą, czy przelewami bankowymi.
Pierwszym sklepem internetowym wykorzystującym MikroPłatności jest Amazonia.pl – sklep oferujący swoim klientom gry komputerowe i recenzje.