Jak działa PayByNet? Na stronie sklepu internetowego klient dokonuje wyboru towaru. Następnie zostaje przekierowany do systemu PayByNet, gdzie prezentowana jest informacja o zakupie oraz lista banków, za pośrednictwem których można zrealizować płatność. Po dokonaniu wyboru banku i zatwierdzeniu poprawności danych, zostaje przekierowany do systemu bankowości elektronicznej danego banku.
Po akceptacji polecenia przelewu przez klienta, sklep otrzymuje informację z systemu PayByNet o zatwierdzeniu płatności. To pozwala na natychmiastową realizację zamówienia. Środki pieniężne wpływają na rachunek sklepu internetowego w standardowym trybie rozliczeniowym.
Zdaniem przedstawicieli Krajowej Izby Rozliczeniowej, która uruchomiła usługę, w praktyce sklep otrzymuje informację o płatności zanim pieniądze faktycznie znajdą się na jego koncie.
Jako pierwsi z PayByNet mogą skorzystać klienci Nordea Bank Polska oraz sklepu Astabe.com. W najbliższym czasie do systemu mają dołączyć także kolejne banki oraz sklepy internetowe.